施工過程中，水、電、蒸汽、壓縮空氣的供應(yīng)必須完全可靠。食物通過的系統(tǒng)必須保證無菌，進(jìn)入包裝容器時食物經(jīng)過的空間環(huán)境必須保證無菌。
另外，無菌包裝一般使用大型設(shè)備，特別是食品滅菌器和無菌包裝機(jī)，設(shè)備投資大，費(fèi)用高。運(yùn)營及管理衛(wèi)生要求嚴(yán)格，難度高，一旦污染，就會成批報廢，造成浪費(fèi)，損害的全性質(zhì)強(qiáng)，不適合生產(chǎn)少量多種產(chǎn)品，造成浪費(fèi)，損失大，一般只用于食品。
無菌包裝機(jī)從滅菌到無菌灌裝，到包裝密封的全過程，都要防止外部微生物入侵，食品流動的各個連接部位都要有可靠的密封，防止食品被系統(tǒng)外部微生物污染。無菌包裝過程中要注意微生物的二次污染。滅菌食品和包裝容器直接接觸空氣的時間應(yīng)降至最低。包裝前先對包裝機(jī)器和操作環(huán)境進(jìn)行無菌處理。
包裝機(jī)使用熱堿水洗、稀鹽酸中和、熱水精煉、高溫蒸汽消毒。工作環(huán)境可以用化學(xué)和物理兩種方法進(jìn)行無菌處理，一般無菌室配有空氣過濾裝置和紫外線殺菌裝置，無菌室經(jīng)常保持無菌狀態(tài)。可以定期利用紫外線殺死在空氣中游動的微生物。確保無菌室的清潔度、溫度、濕度符合規(guī)定標(biāo)準(zhǔn)(一般在18左右，濕度一般為55)。
工作環(huán)境除菌是為了防止細(xì)菌及其他污物進(jìn)入工作環(huán)境。細(xì)菌清除方式主要采用過濾除塵方式，一般無菌工作空間的空氣通過消毒、二次過濾、加熱消毒生產(chǎn)無菌超壓空氣，超壓狀態(tài)應(yīng)防止環(huán)境流菌空氣滲透到無菌工作空間。常用的環(huán)氧乙烷滅菌包裝機(jī)械需要環(huán)氧乙烷氣體對塑料提高溫度和減壓的方法加快揮發(fā)。
運(yùn)輸過程中要保持接頭、閥門、換熱器、均勻器、泵等的密封，使系統(tǒng)內(nèi)部保持正壓力，防止外部空氣進(jìn)入。同時，傳送帶要求盡可能簡單，容易清潔。無菌包設(shè)備的消毒處理通常使用CIP現(xiàn)場清潔系統(tǒng)進(jìn)行，根據(jù)產(chǎn)品種類，可以根據(jù)滅菌要求設(shè)置清潔程序。是關(guān)于環(huán)境的。
確保包裝的密封無菌：包裝封口是無菌包裝的最后一道工序，直接影響產(chǎn)品的包裝質(zhì)量和儲存時間。這一要求可以防止微生物、氣體和蒸汽的入侵，而不允許產(chǎn)品本身的氣味和液體泄漏。大部分無菌包裝的密封。
密封時要注意密封面的壓力均勻分布。密封過程的條件(如密封溫度、時間、壓力)必須有安全邊界，并且可以控制。封面要避免產(chǎn)品或其他污物
